قصه ی سریالnbsp;پایتختnbsp;5 درباره یک خانواده است که هر بار ماجراهایی را تجربه می کنند. خانواده نقی معمولی به دلایل منطقی مجبور می شوند سر از یک کشور خارجی (قبرس) در بیاورند و آنجا با ماجراهایی گره می خورند که همبستگی خانواده، عشق و علاقه آنها به همدیگر، اهمیت وطن و دور هم بودن را بیشتر از گذشته درک می کنند